El fondo antiguo del IER reúne las publicaciones editadas entre los años 1501-1900 y consta de unos 3.200 volúmenes, formando parte del Patrimonio Bibliográfico de La Rioja.
Fue catalogado recientemente por medio de un convenio con el Ministerio de Cultura, para integrarse en el Catálogo Colectivo del Patrimonio Bibliográfico Español (CCPB) y puede consultarse igualmente a través del catálogo en línea de la red de Bibliotecas de La Rioja.
El incremento de los fondos de la Biblioteca se realiza habitualmente por medio de las publicaciones propias y a través del intercambio de las publicaciones del IER con otros organismos. Los fondos también se incrementan, como ya hemos mencionado, por adquisiciones o por donaciones institucionales o de particulares.
El fondo moderno comprende el conjunto de documentos posteriores a 1901, editados sobre cualquier tipo de soporte, que se puede consultar en el catálogo en línea de la Biblioteca de La Rioja
. Los registros aportados hasta hoy desde el IER a la base de datos de la red, ascienden a 19.890 volúmenes. Entre los cuales se pueden incluir una buena parte de los siguientes:
·Libros y folletos: generales y de La Rioja.
·Publicaciones periódicas: generales y de La Rioja.
·Legados: De Eladio del Campo, Familia Manzanares, María Martínez Sierra, Hermanas Piudo, Fernández Aldana, Julián Martínez Ruiz, Mayela Balmaseda, Alfonso Rubio Hernández, Dámaso Ruiz de Clavijo y Hermanos Zapater, Miguel Salvador Carreras, Celestino Martínez.
·Audiovisuales: vídeos, discos, casetes, CDs, DVDs, fotografías y postales.