La Red de Autoridades Ambientales se organiza en torno a la siguiente estructura:
- El Plenario que esta integrado por la totalidad de los miembros de la Red. Su objetivo es la aproximación de las autoridades de gestión de Fondos y las autoridades ambientales para encontrar el necesario apoyo mutuo. Sus reuniones se desarrollan de manera rotatoria en las diferentes Comunidades Autónomas con una periodicidad semestral. (Documentación últimas reuniones plenarias)
- El Secretariado es quien representa a la Red y organiza las actividades y encuentros de la misma.
De acuerdo con el Real Decreto 401/2012, de 17 de febrero, por el que se desarrolla la estructura orgánica básica del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente, corresponde a la Dirección General de Servicios la organización y gestión del Secretariado de la Red de Autoridades Ambientales, a través de la Oficina Presupuestaria.