El municipio de Agoncillo disponía de una depuradora antigua y con una capacidad de tratamiento muy limitada. Ante esta situación se conduce el vertido de aguas residuales de esta población hasta la instalación de nueva construcción ubicada en término de Arrúbal, que se proyectó con capacidad para tratar los vertidos de esas dos poblaciones y del Polígono Industrial de El Sequero.
La infraestructura consta de una instalación de bombeo, precedida de un sistema de desbaste del agua residual, y de un colector de 3.080 m que enlaza el pozo de bombeo con el emisario general, en el término municipal de Arrúbal. Complementariamente, y en el mismo recinto donde se ubica el pozo de bombeo, se ha dispuesto un tamiz de aliviadero para tratar los excesos de caudal que no puedan ser impulsados a la depuradora en momentos de lluvia.
Aprovechando el reactor de la antigua depuradora, en cuyo recinto se ubican estas instalaciones, se ha configurado un tanque de tormentas, para retener los primeros caudales evacuados por el aliviadero, de forma que se reduzcan al mínimo los vertidos directos al río.
El emisario se ha ejecutado en tubería de presión de PVC de 315 mm de diámetro. Su trazado comienza en las instalaciones de la depuradora actual, llega hasta el camino de Agoncillo a Arrúbal, paralelo a la tubería existente, y el resto discurre en su totalidad por el camino público de Agoncillo a Arrúbal hasta conectar con el colector general en el paraje Valhondo.

